Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP1A2P50993 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP1A2P50993 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP1A2P50993 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP1A2P50993 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP1A2P50993 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP1A2P50993 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP1A2P50993 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP1A2P50993 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP1A2P50993 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP1A2P50993 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP1A2P50993 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP1A2P50993 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP1A2P50993 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP1A2P50993 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP1A2P50993 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP1A2P50993 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP1A2P50993 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP1A2P50993 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP1A2P50993 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP1A2P50993 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP1A2P50993 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP1A2P50993 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms