Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCT8P50990 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCT8P50990 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCT8P50990 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT8P50990 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT8P50990 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT8P50990 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT8P50990 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT8P50990 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCT8P50990 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCT8P50990 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCT8P50990 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCT8P50990 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCT8P50990 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT8P50990 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT8P50990 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT8P50990 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT8P50990 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT8P50990 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT8P50990 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT8P50990 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT8P50990 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT8P50990 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT8P50990 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT8P50990 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT8P50990 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT8P50990 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCT8P50990 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCT8P50990 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT8P50990 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT8P50990 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT8P50990 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT8P50990 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCT8P50990 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCT8P50990 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCT8P50990 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT8P50990 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT8P50990 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT8P50990 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT8P50990 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT8P50990 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCT8P50990 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCT8P50990 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCT8P50990 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCT8P50990 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCT8P50990 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCT8P50990 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT8P50990 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT8P50990 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT8P50990 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT8P50990 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCT8P50990 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCT8P50990 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCT8P50990 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCT8P50990 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCT8P50990 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCT8P50990 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCT8P50990 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCT8P50990 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCT8P50990 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCT8P50990 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCT8P50990 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCT8P50990 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT8P50990 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT8P50990 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT8P50990 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT8P50990 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT8P50990 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT8P50990 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT8P50990 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT8P50990 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT8P50990 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCT8P50990 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCT8P50990 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT8P50990 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms