Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPFP49454 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPFP49454 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPFP49454 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPFP49454 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPFP49454 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPFP49454 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPFP49454 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPFP49454 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CENPFP49454 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CENPFP49454 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CENPFP49454 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPFP49454 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPFP49454 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPFP49454 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPFP49454 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPFP49454 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPFP49454 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPFP49454 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPFP49454 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPFP49454 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPFP49454 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPFP49454 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPFP49454 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPFP49454 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPFP49454 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPFP49454 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPFP49454 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPFP49454 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPFP49454 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPFP49454 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPFP49454 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPFP49454 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPFP49454 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPFP49454 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPFP49454 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPFP49454 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPFP49454 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPFP49454 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPFP49454 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPFP49454 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPFP49454 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPFP49454 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPFP49454 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPFP49454 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPFP49454 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPFP49454 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPFP49454 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPFP49454 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPFP49454 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPFP49454 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPFP49454 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPFP49454 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPFP49454 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPFP49454 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPFP49454 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CENPFP49454 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CENPFP49454 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CENPFP49454 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CENPFP49454 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CENPFP49454 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CENPFP49454 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CENPFP49454 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPFP49454 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPFP49454 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CENPFP49454 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CENPFP49454 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CENPFP49454 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CENPFP49454 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CENPFP49454 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CENPFP49454 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CENPFP49454 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPFP49454 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPFP49454 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPFP49454 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPFP49454 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPFP49454 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPFP49454 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPFP49454 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPFP49454 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPFP49454 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPFP49454 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPFP49454 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPFP49454 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPFP49454 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPFP49454 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPFP49454 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPFP49454 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPFP49454 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPFP49454 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPFP49454 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPFP49454 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPFP49454 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPFP49454 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPFP49454 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPFP49454 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPFP49454 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPFP49454 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPFP49454 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPFP49454 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms