Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPTX2P47972 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPTX2P47972 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPTX2P47972 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPTX2P47972 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPTX2P47972 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NPTX2P47972 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPTX2P47972 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPTX2P47972 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPTX2P47972 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPTX2P47972 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms