Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLD1P28340 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLD1P28340 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLD1P28340 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLD1P28340 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLD1P28340 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLD1P28340 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLD1P28340 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLD1P28340 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
POLD1P28340 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLD1P28340 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
POLD1P28340 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
POLD1P28340 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
POLD1P28340 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
POLD1P28340 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
POLD1P28340 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
POLD1P28340 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
POLD1P28340 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
POLD1P28340 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLD1P28340 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLD1P28340 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLD1P28340 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLD1P28340 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLD1P28340 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
POLD1P28340 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLD1P28340 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLD1P28340 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
POLD1P28340 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
POLD1P28340 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
POLD1P28340 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
POLD1P28340 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
POLD1P28340 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLD1P28340 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLD1P28340 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
POLD1P28340 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLD1P28340 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLD1P28340 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
POLD1P28340 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
POLD1P28340 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
POLD1P28340 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
POLD1P28340 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
POLD1P28340 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
POLD1P28340 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLD1P28340 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLD1P28340 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
POLD1P28340 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLD1P28340 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLD1P28340 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLD1P28340 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
POLD1P28340 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLD1P28340 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLD1P28340 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLD1P28340 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLD1P28340 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
POLD1P28340 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
POLD1P28340 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
POLD1P28340 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
POLD1P28340 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
POLD1P28340 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLD1P28340 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLD1P28340 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
POLD1P28340 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLD1P28340 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
POLD1P28340 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
POLD1P28340 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLD1P28340 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
POLD1P28340 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLD1P28340 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLD1P28340 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLD1P28340 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLD1P28340 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLD1P28340 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
POLD1P28340 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLD1P28340 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLD1P28340 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLD1P28340 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLD1P28340 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLD1P28340 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLD1P28340 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLD1P28340 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLD1P28340 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
POLD1P28340 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
POLD1P28340 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLD1P28340 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
POLD1P28340 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLD1P28340 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLD1P28340 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLD1P28340 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLD1P28340 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLD1P28340 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLD1P28340 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLD1P28340 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLD1P28340 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLD1P28340 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLD1P28340 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLD1P28340 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
POLD1P28340 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLD1P28340 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLD1P28340 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLD1P28340 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms