Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIFP27352 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIFP27352 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GIFP27352 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GIFP27352 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GIFP27352 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIFP27352 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIFP27352 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIFP27352 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIFP27352 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIFP27352 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIFP27352 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIFP27352 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIFP27352 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIFP27352 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIFP27352 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIFP27352 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIFP27352 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIFP27352 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIFP27352 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIFP27352 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIFP27352 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIFP27352 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIFP27352 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIFP27352 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIFP27352 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIFP27352 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIFP27352 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIFP27352 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIFP27352 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIFP27352 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIFP27352 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIFP27352 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIFP27352 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIFP27352 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIFP27352 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIFP27352 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIFP27352 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIFP27352 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIFP27352 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIFP27352 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIFP27352 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIFP27352 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIFP27352 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIFP27352 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GIFP27352 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIFP27352 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIFP27352 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIFP27352 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIFP27352 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GIFP27352 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIFP27352 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIFP27352 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIFP27352 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIFP27352 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIFP27352 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIFP27352 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIFP27352 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIFP27352 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIFP27352 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIFP27352 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIFP27352 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIFP27352 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIFP27352 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIFP27352 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIFP27352 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIFP27352 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIFP27352 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIFP27352 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIFP27352 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIFP27352 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIFP27352 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIFP27352 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIFP27352 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIFP27352 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIFP27352 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIFP27352 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIFP27352 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIFP27352 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIFP27352 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GIFP27352 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIFP27352 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIFP27352 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIFP27352 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIFP27352 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIFP27352 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GIFP27352 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIFP27352 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIFP27352 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIFP27352 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIFP27352 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIFP27352 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIFP27352 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIFP27352 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIFP27352 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIFP27352 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIFP27352 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIFP27352 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIFP27352 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIFP27352 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms