Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL3RAP26951 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL3RAP26951 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL3RAP26951 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL3RAP26951 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL3RAP26951 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL3RAP26951 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL3RAP26951 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL3RAP26951 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL3RAP26951 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL3RAP26951 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL3RAP26951 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL3RAP26951 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL3RAP26951 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IL3RAP26951 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IL3RAP26951 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL3RAP26951 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3RAP26951 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL3RAP26951 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms