Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR2AP24928 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR2AP24928 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLR2AP24928 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR2AP24928 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR2AP24928 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR2AP24928 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
POLR2AP24928 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLR2AP24928 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR2AP24928 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR2AP24928 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR2AP24928 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR2AP24928 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR2AP24928 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR2AP24928 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR2AP24928 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR2AP24928 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
POLR2AP24928 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
POLR2AP24928 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR2AP24928 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR2AP24928 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR2AP24928 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLR2AP24928 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLR2AP24928 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLR2AP24928 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR2AP24928 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR2AP24928 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR2AP24928 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR2AP24928 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
POLR2AP24928 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
POLR2AP24928 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLR2AP24928 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
POLR2AP24928 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLR2AP24928 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLR2AP24928 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLR2AP24928 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLR2AP24928 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLR2AP24928 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLR2AP24928 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
POLR2AP24928 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLR2AP24928 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLR2AP24928 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLR2AP24928 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
POLR2AP24928 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLR2AP24928 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
POLR2AP24928 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
POLR2AP24928 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
POLR2AP24928 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
POLR2AP24928 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
POLR2AP24928 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
POLR2AP24928 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
POLR2AP24928 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
POLR2AP24928 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
POLR2AP24928 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
POLR2AP24928 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLR2AP24928 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
POLR2AP24928 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
POLR2AP24928 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
POLR2AP24928 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
POLR2AP24928 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
POLR2AP24928 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
POLR2AP24928 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
POLR2AP24928 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLR2AP24928 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLR2AP24928 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLR2AP24928 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLR2AP24928 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
POLR2AP24928 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLR2AP24928 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
POLR2AP24928 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLR2AP24928 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLR2AP24928 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLR2AP24928 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
POLR2AP24928 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLR2AP24928 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLR2AP24928 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLR2AP24928 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms