Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBL4AP11441 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBL4AP11441 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UBL4AP11441 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UBL4AP11441 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBL4AP11441 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBL4AP11441 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBL4AP11441 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBL4AP11441 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBL4AP11441 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBL4AP11441 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBL4AP11441 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBL4AP11441 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBL4AP11441 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBL4AP11441 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBL4AP11441 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBL4AP11441 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBL4AP11441 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBL4AP11441 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms