Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD55P08174 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD55P08174 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD55P08174 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD55P08174 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD55P08174 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD55P08174 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD55P08174 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD55P08174 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD55P08174 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD55P08174 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD55P08174 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD55P08174 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD55P08174 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD55P08174 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD55P08174 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD55P08174 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD55P08174 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD55P08174 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD55P08174 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD55P08174 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD55P08174 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD55P08174 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD55P08174 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD55P08174 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD55P08174 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD55P08174 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD55P08174 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CD55P08174 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD55P08174 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD55P08174 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD55P08174 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD55P08174 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD55P08174 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD55P08174 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD55P08174 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD55P08174 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD55P08174 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD55P08174 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD55P08174 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD55P08174 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD55P08174 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD55P08174 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD55P08174 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CD55P08174 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD55P08174 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD55P08174 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD55P08174 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CD55P08174 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD55P08174 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD55P08174 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD55P08174 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD55P08174 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD55P08174 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD55P08174 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD55P08174 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD55P08174 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD55P08174 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD55P08174 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD55P08174 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD55P08174 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD55P08174 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD55P08174 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD55P08174 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD55P08174 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD55P08174 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD55P08174 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD55P08174 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD55P08174 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CD55P08174 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD55P08174 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD55P08174 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD55P08174 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD55P08174 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD55P08174 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD55P08174 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD55P08174 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD55P08174 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD55P08174 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD55P08174 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD55P08174 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD55P08174 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms