Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX7O95931 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX7O95931 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX7O95931 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX7O95931 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX7O95931 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX7O95931 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX7O95931 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX7O95931 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX7O95931 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX7O95931 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX7O95931 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX7O95931 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX7O95931 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX7O95931 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CBX7O95931 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX7O95931 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX7O95931 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX7O95931 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX7O95931 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX7O95931 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX7O95931 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX7O95931 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX7O95931 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX7O95931 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX7O95931 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX7O95931 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX7O95931 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX7O95931 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX7O95931 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX7O95931 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX7O95931 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX7O95931 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX7O95931 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBX7O95931 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX7O95931 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX7O95931 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX7O95931 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX7O95931 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX7O95931 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX7O95931 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX7O95931 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX7O95931 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX7O95931 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX7O95931 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX7O95931 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX7O95931 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX7O95931 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX7O95931 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX7O95931 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX7O95931 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX7O95931 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX7O95931 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX7O95931 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX7O95931 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBX7O95931 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX7O95931 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX7O95931 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX7O95931 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX7O95931 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX7O95931 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX7O95931 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX7O95931 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX7O95931 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX7O95931 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX7O95931 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX7O95931 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX7O95931 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX7O95931 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX7O95931 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX7O95931 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX7O95931 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX7O95931 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX7O95931 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX7O95931 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX7O95931 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX7O95931 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX7O95931 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX7O95931 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX7O95931 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX7O95931 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX7O95931 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX7O95931 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX7O95931 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX7O95931 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX7O95931 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX7O95931 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX7O95931 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX7O95931 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX7O95931 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX7O95931 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX7O95931 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX7O95931 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX7O95931 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX7O95931 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX7O95931 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX7O95931 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX7O95931 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX7O95931 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX7O95931 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms