Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF1O95521 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF1O95521 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF1O95521 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF1O95521 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF1O95521 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF1O95521 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF1O95521 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF1O95521 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF1O95521 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF1O95521 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF1O95521 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF1O95521 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF1O95521 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF1O95521 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF1O95521 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF1O95521 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF1O95521 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF1O95521 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF1O95521 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF1O95521 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF1O95521 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF1O95521 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF1O95521 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF1O95521 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF1O95521 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF1O95521 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF1O95521 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF1O95521 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF1O95521 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF1O95521 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF1O95521 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF1O95521 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms