Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
RAPGEF3O95398 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAPGEF3O95398 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAPGEF3O95398 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAPGEF3O95398 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAPGEF3O95398 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAPGEF3O95398 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAPGEF3O95398 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAPGEF3O95398 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAPGEF3O95398 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RAPGEF3O95398 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RAPGEF3O95398 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RAPGEF3O95398 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
RAPGEF3O95398 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
RAPGEF3O95398 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
RAPGEF3O95398 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
RAPGEF3O95398 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
RAPGEF3O95398 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
RAPGEF3O95398 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
RAPGEF3O95398 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
RAPGEF3O95398 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
RAPGEF3O95398 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RAPGEF3O95398 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
RAPGEF3O95398 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RAPGEF3O95398 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
RAPGEF3O95398 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
RAPGEF3O95398 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
RAPGEF3O95398 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
RAPGEF3O95398 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.06■■■■■ 4
RAPGEF3O95398 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
RAPGEF3O95398 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RAPGEF3O95398 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
RAPGEF3O95398 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
RAPGEF3O95398 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
RAPGEF3O95398 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
RAPGEF3O95398 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
RAPGEF3O95398 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
RAPGEF3O95398 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
RAPGEF3O95398 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
RAPGEF3O95398 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
RAPGEF3O95398 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
RAPGEF3O95398 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
RAPGEF3O95398 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAPGEF3O95398 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAPGEF3O95398 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAPGEF3O95398 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAPGEF3O95398 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
RAPGEF3O95398 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAPGEF3O95398 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RAPGEF3O95398 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RAPGEF3O95398 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
RAPGEF3O95398 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
RAPGEF3O95398 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
RAPGEF3O95398 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
RAPGEF3O95398 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
RAPGEF3O95398 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
RAPGEF3O95398 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
RAPGEF3O95398 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
RAPGEF3O95398 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
RAPGEF3O95398 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
RAPGEF3O95398 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
RAPGEF3O95398 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
RAPGEF3O95398 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
RAPGEF3O95398 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
RAPGEF3O95398 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
RAPGEF3O95398 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
RAPGEF3O95398 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
RAPGEF3O95398 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.75■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
RAPGEF3O95398 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
RAPGEF3O95398 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms