Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNDBP1O95273 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNDBP1O95273 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNDBP1O95273 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNDBP1O95273 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNDBP1O95273 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNDBP1O95273 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNDBP1O95273 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNDBP1O95273 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNDBP1O95273 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNDBP1O95273 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNDBP1O95273 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNDBP1O95273 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNDBP1O95273 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNDBP1O95273 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNDBP1O95273 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1O95273 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
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