Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE4BO95155 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBE4BO95155 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE4BO95155 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE4BO95155 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE4BO95155 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE4BO95155 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE4BO95155 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE4BO95155 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4BO95155 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4BO95155 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4BO95155 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE4BO95155 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE4BO95155 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE4BO95155 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE4BO95155 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE4BO95155 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE4BO95155 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE4BO95155 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE4BO95155 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE4BO95155 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE4BO95155 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE4BO95155 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE4BO95155 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE4BO95155 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE4BO95155 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE4BO95155 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE4BO95155 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE4BO95155 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE4BO95155 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBE4BO95155 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE4BO95155 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE4BO95155 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE4BO95155 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms