Protein–RNA interactions for Protein: O75679

RFPL3, Ret finger protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3O75679 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFPL3O75679 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RFPL3O75679 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFPL3O75679 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFPL3O75679 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFPL3O75679 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFPL3O75679 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RFPL3O75679 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFPL3O75679 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFPL3O75679 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFPL3O75679 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFPL3O75679 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFPL3O75679 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFPL3O75679 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms