Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
OFD1O75665 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
OFD1O75665 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
OFD1O75665 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
OFD1O75665 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
OFD1O75665 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
OFD1O75665 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
OFD1O75665 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
OFD1O75665 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
OFD1O75665 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
OFD1O75665 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
OFD1O75665 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
OFD1O75665 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
OFD1O75665 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
OFD1O75665 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
OFD1O75665 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
OFD1O75665 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
OFD1O75665 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
OFD1O75665 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
OFD1O75665 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
OFD1O75665 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
OFD1O75665 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
OFD1O75665 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
OFD1O75665 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
OFD1O75665 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
OFD1O75665 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
OFD1O75665 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
OFD1O75665 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
OFD1O75665 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
OFD1O75665 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
OFD1O75665 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
OFD1O75665 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
OFD1O75665 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
OFD1O75665 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
OFD1O75665 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
OFD1O75665 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
OFD1O75665 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OFD1O75665 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
OFD1O75665 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
OFD1O75665 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
OFD1O75665 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
OFD1O75665 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
OFD1O75665 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
OFD1O75665 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
OFD1O75665 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
OFD1O75665 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
OFD1O75665 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
OFD1O75665 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
OFD1O75665 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
OFD1O75665 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
OFD1O75665 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
OFD1O75665 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
OFD1O75665 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
OFD1O75665 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
OFD1O75665 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
OFD1O75665 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
OFD1O75665 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
OFD1O75665 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
OFD1O75665 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
OFD1O75665 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
OFD1O75665 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
OFD1O75665 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
OFD1O75665 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
OFD1O75665 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
OFD1O75665 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
OFD1O75665 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
OFD1O75665 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
OFD1O75665 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
OFD1O75665 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
OFD1O75665 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
OFD1O75665 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
OFD1O75665 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
OFD1O75665 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OFD1O75665 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
OFD1O75665 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OFD1O75665 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
OFD1O75665 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OFD1O75665 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OFD1O75665 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OFD1O75665 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OFD1O75665 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OFD1O75665 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OFD1O75665 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
OFD1O75665 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
OFD1O75665 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
OFD1O75665 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
OFD1O75665 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
OFD1O75665 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
OFD1O75665 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
OFD1O75665 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
OFD1O75665 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
OFD1O75665 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
OFD1O75665 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
OFD1O75665 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
OFD1O75665 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
OFD1O75665 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
OFD1O75665 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
OFD1O75665 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
OFD1O75665 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
OFD1O75665 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms