Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CLDN11O75508 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN11O75508 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLDN11O75508 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN11O75508 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN11O75508 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN11O75508 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN11O75508 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN11O75508 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN11O75508 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN11O75508 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN11O75508 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN11O75508 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN11O75508 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms