Protein–RNA interactions for Protein: O75417

POLQ, DNA polymerase theta, humanhuman

Predictions only

Length 2,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLQO75417 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLQO75417 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLQO75417 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLQO75417 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLQO75417 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLQO75417 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLQO75417 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLQO75417 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLQO75417 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLQO75417 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLQO75417 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLQO75417 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLQO75417 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLQO75417 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLQO75417 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLQO75417 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLQO75417 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLQO75417 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLQO75417 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLQO75417 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLQO75417 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLQO75417 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLQO75417 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLQO75417 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLQO75417 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLQO75417 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLQO75417 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLQO75417 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLQO75417 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLQO75417 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLQO75417 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLQO75417 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLQO75417 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLQO75417 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLQO75417 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLQO75417 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLQO75417 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLQO75417 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLQO75417 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLQO75417 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLQO75417 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLQO75417 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLQO75417 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLQO75417 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLQO75417 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLQO75417 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLQO75417 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLQO75417 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLQO75417 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLQO75417 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLQO75417 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLQO75417 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLQO75417 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLQO75417 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLQO75417 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLQO75417 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLQO75417 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLQO75417 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLQO75417 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLQO75417 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLQO75417 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLQO75417 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLQO75417 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLQO75417 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLQO75417 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLQO75417 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLQO75417 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLQO75417 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLQO75417 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLQO75417 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLQO75417 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLQO75417 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLQO75417 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLQO75417 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLQO75417 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLQO75417 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLQO75417 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLQO75417 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLQO75417 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLQO75417 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLQO75417 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLQO75417 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLQO75417 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLQO75417 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLQO75417 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLQO75417 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLQO75417 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLQO75417 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLQO75417 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLQO75417 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLQO75417 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLQO75417 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLQO75417 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLQO75417 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLQO75417 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLQO75417 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLQO75417 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLQO75417 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLQO75417 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLQO75417 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms