Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT3O75175 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT3O75175 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT3O75175 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT3O75175 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT3O75175 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT3O75175 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT3O75175 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT3O75175 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT3O75175 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT3O75175 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT3O75175 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT3O75175 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT3O75175 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT3O75175 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT3O75175 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms