Protein–RNA interactions for Protein: O60673

REV3L, DNA polymerase zeta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 3,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV3LO60673 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
REV3LO60673 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
REV3LO60673 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
REV3LO60673 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
REV3LO60673 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
REV3LO60673 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
REV3LO60673 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
REV3LO60673 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
REV3LO60673 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
REV3LO60673 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
REV3LO60673 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
REV3LO60673 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
REV3LO60673 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
REV3LO60673 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
REV3LO60673 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
REV3LO60673 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
REV3LO60673 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
REV3LO60673 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
REV3LO60673 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
REV3LO60673 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
REV3LO60673 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
REV3LO60673 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
REV3LO60673 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
REV3LO60673 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
REV3LO60673 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
REV3LO60673 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
REV3LO60673 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
REV3LO60673 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
REV3LO60673 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
REV3LO60673 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
REV3LO60673 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
REV3LO60673 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
REV3LO60673 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
REV3LO60673 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
REV3LO60673 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
REV3LO60673 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
REV3LO60673 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
REV3LO60673 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
REV3LO60673 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
REV3LO60673 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
REV3LO60673 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
REV3LO60673 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
REV3LO60673 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
REV3LO60673 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
REV3LO60673 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
REV3LO60673 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
REV3LO60673 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
REV3LO60673 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
REV3LO60673 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
REV3LO60673 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
REV3LO60673 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
REV3LO60673 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
REV3LO60673 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
REV3LO60673 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
REV3LO60673 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
REV3LO60673 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
REV3LO60673 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
REV3LO60673 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
REV3LO60673 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
REV3LO60673 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
REV3LO60673 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
REV3LO60673 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
REV3LO60673 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
REV3LO60673 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
REV3LO60673 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
REV3LO60673 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
REV3LO60673 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
REV3LO60673 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
REV3LO60673 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REV3LO60673 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
REV3LO60673 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
REV3LO60673 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
REV3LO60673 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
REV3LO60673 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
REV3LO60673 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
REV3LO60673 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
REV3LO60673 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
REV3LO60673 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
REV3LO60673 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
REV3LO60673 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REV3LO60673 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REV3LO60673 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REV3LO60673 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REV3LO60673 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
REV3LO60673 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
REV3LO60673 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REV3LO60673 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
REV3LO60673 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
REV3LO60673 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
REV3LO60673 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
REV3LO60673 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
REV3LO60673 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
REV3LO60673 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
REV3LO60673 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
REV3LO60673 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
REV3LO60673 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
REV3LO60673 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
REV3LO60673 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
REV3LO60673 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
REV3LO60673 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms