Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCMT2O60294 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LCMT2O60294 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCMT2O60294 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCMT2O60294 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCMT2O60294 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LCMT2O60294 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCMT2O60294 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCMT2O60294 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCMT2O60294 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCMT2O60294 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCMT2O60294 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCMT2O60294 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCMT2O60294 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCMT2O60294 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCMT2O60294 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCMT2O60294 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCMT2O60294 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCMT2O60294 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCMT2O60294 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LCMT2O60294 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCMT2O60294 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCMT2O60294 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCMT2O60294 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCMT2O60294 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCMT2O60294 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LCMT2O60294 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCMT2O60294 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCMT2O60294 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LCMT2O60294 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCMT2O60294 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCMT2O60294 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LCMT2O60294 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LCMT2O60294 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCMT2O60294 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCMT2O60294 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LCMT2O60294 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCMT2O60294 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCMT2O60294 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCMT2O60294 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCMT2O60294 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms