Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MAP3K13O43283 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAP3K13O43283 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAP3K13O43283 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAP3K13O43283 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAP3K13O43283 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAP3K13O43283 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MAP3K13O43283 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MAP3K13O43283 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MAP3K13O43283 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MAP3K13O43283 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MAP3K13O43283 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MAP3K13O43283 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MAP3K13O43283 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MAP3K13O43283 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MAP3K13O43283 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MAP3K13O43283 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MAP3K13O43283 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAP3K13O43283 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms