Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC7A4O43246 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC7A4O43246 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC7A4O43246 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC7A4O43246 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms