Protein–RNA interactions for Protein: O00512

BCL9, B-cell CLL/lymphoma 9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL9O00512 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
BCL9O00512 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
BCL9O00512 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
BCL9O00512 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BCL9O00512 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
BCL9O00512 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
BCL9O00512 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
BCL9O00512 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
BCL9O00512 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
BCL9O00512 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BCL9O00512 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BCL9O00512 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BCL9O00512 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BCL9O00512 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BCL9O00512 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BCL9O00512 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
BCL9O00512 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BCL9O00512 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BCL9O00512 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
BCL9O00512 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BCL9O00512 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BCL9O00512 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
BCL9O00512 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BCL9O00512 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BCL9O00512 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
BCL9O00512 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
BCL9O00512 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BCL9O00512 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BCL9O00512 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BCL9O00512 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BCL9O00512 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BCL9O00512 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
BCL9O00512 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
BCL9O00512 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BCL9O00512 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BCL9O00512 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BCL9O00512 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BCL9O00512 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BCL9O00512 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BCL9O00512 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BCL9O00512 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BCL9O00512 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
BCL9O00512 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BCL9O00512 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
BCL9O00512 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BCL9O00512 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BCL9O00512 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BCL9O00512 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BCL9O00512 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
BCL9O00512 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BCL9O00512 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BCL9O00512 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
BCL9O00512 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BCL9O00512 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BCL9O00512 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BCL9O00512 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BCL9O00512 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BCL9O00512 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BCL9O00512 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BCL9O00512 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BCL9O00512 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BCL9O00512 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BCL9O00512 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
BCL9O00512 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BCL9O00512 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
BCL9O00512 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
BCL9O00512 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BCL9O00512 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BCL9O00512 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BCL9O00512 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BCL9O00512 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BCL9O00512 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BCL9O00512 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BCL9O00512 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BCL9O00512 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
BCL9O00512 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
BCL9O00512 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BCL9O00512 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BCL9O00512 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
BCL9O00512 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BCL9O00512 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BCL9O00512 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
BCL9O00512 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BCL9O00512 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
BCL9O00512 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
BCL9O00512 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BCL9O00512 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BCL9O00512 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BCL9O00512 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BCL9O00512 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
BCL9O00512 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BCL9O00512 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BCL9O00512 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
BCL9O00512 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BCL9O00512 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BCL9O00512 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BCL9O00512 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BCL9O00512 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BCL9O00512 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BCL9O00512 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms