Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP9YO00507 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP9YO00507 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP9YO00507 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP9YO00507 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP9YO00507 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP9YO00507 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP9YO00507 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP9YO00507 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP9YO00507 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP9YO00507 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP9YO00507 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP9YO00507 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP9YO00507 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP9YO00507 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP9YO00507 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP9YO00507 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP9YO00507 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP9YO00507 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP9YO00507 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP9YO00507 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP9YO00507 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP9YO00507 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP9YO00507 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP9YO00507 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP9YO00507 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP9YO00507 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP9YO00507 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP9YO00507 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP9YO00507 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP9YO00507 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP9YO00507 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP9YO00507 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP9YO00507 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP9YO00507 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP9YO00507 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP9YO00507 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP9YO00507 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP9YO00507 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP9YO00507 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP9YO00507 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP9YO00507 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP9YO00507 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP9YO00507 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP9YO00507 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP9YO00507 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP9YO00507 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP9YO00507 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP9YO00507 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP9YO00507 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP9YO00507 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP9YO00507 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP9YO00507 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP9YO00507 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP9YO00507 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP9YO00507 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP9YO00507 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP9YO00507 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP9YO00507 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP9YO00507 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP9YO00507 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP9YO00507 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP9YO00507 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP9YO00507 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP9YO00507 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP9YO00507 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP9YO00507 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP9YO00507 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP9YO00507 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP9YO00507 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP9YO00507 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP9YO00507 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP9YO00507 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP9YO00507 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP9YO00507 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP9YO00507 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP9YO00507 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP9YO00507 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP9YO00507 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP9YO00507 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP9YO00507 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP9YO00507 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP9YO00507 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP9YO00507 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP9YO00507 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP9YO00507 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP9YO00507 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP9YO00507 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP9YO00507 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP9YO00507 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP9YO00507 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP9YO00507 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP9YO00507 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP9YO00507 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP9YO00507 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP9YO00507 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP9YO00507 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP9YO00507 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP9YO00507 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP9YO00507 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms