Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H3BM21 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H3BM21 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H3BM21 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H3BM21 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
H3BM21 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BM21 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BM21 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BM21 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
H3BM21 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H3BM21 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H3BM21 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H3BM21 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BM21 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BM21 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BM21 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BM21 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BM21 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BM21 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BM21 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BM21 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BM21 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BM21 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BM21 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BM21 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BM21 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BM21 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BM21 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BM21 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BM21 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BM21 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BM21 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BM21 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BM21 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BM21 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BM21 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BM21 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BM21 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BM21 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BM21 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BM21 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BM21 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BM21 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BM21 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BM21 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BM21 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BM21 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BM21 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BM21 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BM21 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BM21 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BM21 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BM21 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BM21 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BM21 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BM21 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BM21 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BM21 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H3BM21 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H3BM21 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
H3BM21 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BM21 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BM21 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BM21 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BM21 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BM21 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BM21 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BM21 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BM21 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BM21 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BM21 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BM21 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BM21 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BM21 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BM21 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BM21 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BM21 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BM21 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BM21 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BM21 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BM21 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BM21 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BM21 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BM21 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BM21 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BM21 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H3BM21 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BM21 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BM21 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BM21 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BM21 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BM21 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BM21 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BM21 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BM21 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BM21 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BM21 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BM21 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BM21 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BM21 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms