Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PATL2C9JE40 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PATL2C9JE40 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PATL2C9JE40 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PATL2C9JE40 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PATL2C9JE40 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PATL2C9JE40 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PATL2C9JE40 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PATL2C9JE40 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PATL2C9JE40 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PATL2C9JE40 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PATL2C9JE40 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PATL2C9JE40 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PATL2C9JE40 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PATL2C9JE40 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PATL2C9JE40 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
PATL2C9JE40 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PATL2C9JE40 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PATL2C9JE40 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PATL2C9JE40 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PATL2C9JE40 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PATL2C9JE40 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PATL2C9JE40 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PATL2C9JE40 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PATL2C9JE40 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PATL2C9JE40 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PATL2C9JE40 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PATL2C9JE40 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PATL2C9JE40 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PATL2C9JE40 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PATL2C9JE40 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PATL2C9JE40 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms