Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WIPF3A6NGB9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WIPF3A6NGB9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WIPF3A6NGB9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WIPF3A6NGB9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WIPF3A6NGB9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WIPF3A6NGB9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WIPF3A6NGB9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WIPF3A6NGB9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WIPF3A6NGB9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WIPF3A6NGB9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WIPF3A6NGB9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WIPF3A6NGB9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WIPF3A6NGB9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WIPF3A6NGB9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WIPF3A6NGB9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WIPF3A6NGB9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms