Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf49A4QMS7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf49A4QMS7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf49A4QMS7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf49A4QMS7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf49A4QMS7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf49A4QMS7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf49A4QMS7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf49A4QMS7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf49A4QMS7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf49A4QMS7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf49A4QMS7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf49A4QMS7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf49A4QMS7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf49A4QMS7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf49A4QMS7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf49A4QMS7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C5orf49A4QMS7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf49A4QMS7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms