Protein–RNA interactions for Protein: A1L4Q6

Putative uncharacterized protein FLJ41423, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1L4Q6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A1L4Q6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A1L4Q6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A1L4Q6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A1L4Q6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A1L4Q6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A1L4Q6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A1L4Q6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A1L4Q6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A1L4Q6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A1L4Q6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A1L4Q6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A1L4Q6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A1L4Q6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A1L4Q6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A1L4Q6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A1L4Q6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A1L4Q6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A1L4Q6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
A1L4Q6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A1L4Q6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A1L4Q6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A1L4Q6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A1L4Q6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A1L4Q6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A1L4Q6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A1L4Q6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A1L4Q6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A1L4Q6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A1L4Q6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A1L4Q6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A1L4Q6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A1L4Q6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A1L4Q6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A1L4Q6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A1L4Q6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A1L4Q6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A1L4Q6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A1L4Q6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A1L4Q6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A1L4Q6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A1L4Q6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A1L4Q6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A1L4Q6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A1L4Q6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A1L4Q6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A1L4Q6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A1L4Q6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A1L4Q6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A1L4Q6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A1L4Q6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A1L4Q6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A1L4Q6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
A1L4Q6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A1L4Q6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A1L4Q6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A1L4Q6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A1L4Q6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A1L4Q6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A1L4Q6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A1L4Q6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A1L4Q6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A1L4Q6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A1L4Q6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A1L4Q6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A1L4Q6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A1L4Q6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A1L4Q6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A1L4Q6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A1L4Q6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A1L4Q6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A1L4Q6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A1L4Q6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1L4Q6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1L4Q6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1L4Q6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1L4Q6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1L4Q6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1L4Q6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1L4Q6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1L4Q6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1L4Q6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1L4Q6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A1L4Q6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A1L4Q6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
A1L4Q6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A1L4Q6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A1L4Q6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A1L4Q6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A1L4Q6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A1L4Q6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A1L4Q6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A1L4Q6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A1L4Q6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A1L4Q6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A1L4Q6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A1L4Q6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A1L4Q6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A1L4Q6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A1L4Q6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164 ms