Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A1B0GTW7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A1B0GTW7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A1B0GTW7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A1B0GTW7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A1B0GTW7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A1B0GTW7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A1B0GTW7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A1B0GTW7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A1B0GTW7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A1B0GTW7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A1B0GTW7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1B0GTW7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1B0GTW7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1B0GTW7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1B0GTW7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1B0GTW7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
A0A1B0GTW7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1B0GTW7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms