Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC23IPQ9Y6Y8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC23IPQ9Y6Y8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC23IPQ9Y6Y8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC23IPQ9Y6Y8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC23IPQ9Y6Y8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC23IPQ9Y6Y8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC23IPQ9Y6Y8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC23IPQ9Y6Y8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC23IPQ9Y6Y8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC23IPQ9Y6Y8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC23IPQ9Y6Y8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC23IPQ9Y6Y8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC23IPQ9Y6Y8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC23IPQ9Y6Y8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC23IPQ9Y6Y8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC23IPQ9Y6Y8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC23IPQ9Y6Y8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC23IPQ9Y6Y8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC23IPQ9Y6Y8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC23IPQ9Y6Y8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC23IPQ9Y6Y8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms