Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGB5Q9Y5G0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGB5Q9Y5G0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGB5Q9Y5G0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGB5Q9Y5G0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGB5Q9Y5G0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHGB5Q9Y5G0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGB5Q9Y5G0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGB5Q9Y5G0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGB5Q9Y5G0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGB5Q9Y5G0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGB5Q9Y5G0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGB5Q9Y5G0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGB5Q9Y5G0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGB5Q9Y5G0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGB5Q9Y5G0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGB5Q9Y5G0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGB5Q9Y5G0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHGB5Q9Y5G0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHGB5Q9Y5G0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHGB5Q9Y5G0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHGB5Q9Y5G0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHGB5Q9Y5G0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHGB5Q9Y5G0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHGB5Q9Y5G0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGB5Q9Y5G0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGB5Q9Y5G0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGB5Q9Y5G0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGB5Q9Y5G0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGB5Q9Y5G0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHGB5Q9Y5G0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHGB5Q9Y5G0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGB5Q9Y5G0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGB5Q9Y5G0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHGB5Q9Y5G0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms