Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHB12Q9Y5F1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB12Q9Y5F1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB12Q9Y5F1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB12Q9Y5F1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB12Q9Y5F1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB12Q9Y5F1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB12Q9Y5F1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB12Q9Y5F1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB12Q9Y5F1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB12Q9Y5F1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB12Q9Y5F1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB12Q9Y5F1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHB12Q9Y5F1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHB12Q9Y5F1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHB12Q9Y5F1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHB12Q9Y5F1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB12Q9Y5F1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB12Q9Y5F1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB12Q9Y5F1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB12Q9Y5F1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB12Q9Y5F1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB12Q9Y5F1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB12Q9Y5F1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHB12Q9Y5F1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB12Q9Y5F1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB12Q9Y5F1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB12Q9Y5F1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB12Q9Y5F1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms