Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPR55Q9Y2T6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPR55Q9Y2T6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPR55Q9Y2T6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPR55Q9Y2T6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPR55Q9Y2T6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPR55Q9Y2T6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPR55Q9Y2T6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPR55Q9Y2T6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPR55Q9Y2T6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPR55Q9Y2T6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPR55Q9Y2T6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GPR55Q9Y2T6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPR55Q9Y2T6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPR55Q9Y2T6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPR55Q9Y2T6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPR55Q9Y2T6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPR55Q9Y2T6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPR55Q9Y2T6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPR55Q9Y2T6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPR55Q9Y2T6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPR55Q9Y2T6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR55Q9Y2T6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR55Q9Y2T6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPR55Q9Y2T6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR55Q9Y2T6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR55Q9Y2T6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR55Q9Y2T6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPR55Q9Y2T6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR55Q9Y2T6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms