Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERGIC3Q9Y282 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERGIC3Q9Y282 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERGIC3Q9Y282 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERGIC3Q9Y282 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERGIC3Q9Y282 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERGIC3Q9Y282 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERGIC3Q9Y282 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERGIC3Q9Y282 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERGIC3Q9Y282 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERGIC3Q9Y282 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ERGIC3Q9Y282 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERGIC3Q9Y282 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERGIC3Q9Y282 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERGIC3Q9Y282 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERGIC3Q9Y282 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ERGIC3Q9Y282 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERGIC3Q9Y282 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC3Q9Y282 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC3Q9Y282 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC3Q9Y282 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC3Q9Y282 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC3Q9Y282 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC3Q9Y282 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC3Q9Y282 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC3Q9Y282 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms