Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX7Q9UNH6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX7Q9UNH6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX7Q9UNH6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX7Q9UNH6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX7Q9UNH6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX7Q9UNH6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX7Q9UNH6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX7Q9UNH6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX7Q9UNH6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX7Q9UNH6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX7Q9UNH6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX7Q9UNH6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX7Q9UNH6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX7Q9UNH6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX7Q9UNH6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX7Q9UNH6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX7Q9UNH6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX7Q9UNH6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX7Q9UNH6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms