Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLXNB3Q9ULL4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNB3Q9ULL4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNB3Q9ULL4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLXNB3Q9ULL4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNB3Q9ULL4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNB3Q9ULL4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNB3Q9ULL4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXNB3Q9ULL4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXNB3Q9ULL4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXNB3Q9ULL4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXNB3Q9ULL4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNB3Q9ULL4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLXNB3Q9ULL4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLXNB3Q9ULL4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms