Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERG28Q9UKR5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERG28Q9UKR5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERG28Q9UKR5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms