Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CASP8AP2Q9UKL3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CASP8AP2Q9UKL3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CASP8AP2Q9UKL3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CASP8AP2Q9UKL3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CASP8AP2Q9UKL3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CASP8AP2Q9UKL3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CASP8AP2Q9UKL3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CASP8AP2Q9UKL3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CASP8AP2Q9UKL3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CASP8AP2Q9UKL3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CASP8AP2Q9UKL3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CASP8AP2Q9UKL3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CASP8AP2Q9UKL3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CASP8AP2Q9UKL3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CASP8AP2Q9UKL3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CASP8AP2Q9UKL3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CASP8AP2Q9UKL3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CASP8AP2Q9UKL3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CASP8AP2Q9UKL3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CASP8AP2Q9UKL3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CASP8AP2Q9UKL3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CASP8AP2Q9UKL3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CASP8AP2Q9UKL3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CASP8AP2Q9UKL3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CASP8AP2Q9UKL3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CASP8AP2Q9UKL3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CASP8AP2Q9UKL3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CASP8AP2Q9UKL3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CASP8AP2Q9UKL3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CASP8AP2Q9UKL3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CASP8AP2Q9UKL3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CASP8AP2Q9UKL3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CASP8AP2Q9UKL3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CASP8AP2Q9UKL3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CASP8AP2Q9UKL3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CASP8AP2Q9UKL3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CASP8AP2Q9UKL3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CASP8AP2Q9UKL3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CASP8AP2Q9UKL3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CASP8AP2Q9UKL3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CASP8AP2Q9UKL3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CASP8AP2Q9UKL3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CASP8AP2Q9UKL3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CASP8AP2Q9UKL3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CASP8AP2Q9UKL3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CASP8AP2Q9UKL3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CASP8AP2Q9UKL3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CASP8AP2Q9UKL3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CASP8AP2Q9UKL3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CASP8AP2Q9UKL3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CASP8AP2Q9UKL3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CASP8AP2Q9UKL3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CASP8AP2Q9UKL3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CASP8AP2Q9UKL3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CASP8AP2Q9UKL3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CASP8AP2Q9UKL3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CASP8AP2Q9UKL3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CASP8AP2Q9UKL3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CASP8AP2Q9UKL3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CASP8AP2Q9UKL3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CASP8AP2Q9UKL3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CASP8AP2Q9UKL3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CASP8AP2Q9UKL3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CASP8AP2Q9UKL3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CASP8AP2Q9UKL3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CASP8AP2Q9UKL3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CASP8AP2Q9UKL3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CASP8AP2Q9UKL3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CASP8AP2Q9UKL3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CASP8AP2Q9UKL3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CASP8AP2Q9UKL3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CASP8AP2Q9UKL3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CASP8AP2Q9UKL3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CASP8AP2Q9UKL3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CASP8AP2Q9UKL3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CASP8AP2Q9UKL3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CASP8AP2Q9UKL3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CASP8AP2Q9UKL3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CASP8AP2Q9UKL3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CASP8AP2Q9UKL3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CASP8AP2Q9UKL3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CASP8AP2Q9UKL3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CASP8AP2Q9UKL3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CASP8AP2Q9UKL3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CASP8AP2Q9UKL3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CASP8AP2Q9UKL3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms