Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI8

TLK1, Serine/threonine-protein kinase tousled-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLK1Q9UKI8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TLK1Q9UKI8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TLK1Q9UKI8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TLK1Q9UKI8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLK1Q9UKI8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TLK1Q9UKI8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TLK1Q9UKI8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLK1Q9UKI8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TLK1Q9UKI8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TLK1Q9UKI8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TLK1Q9UKI8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TLK1Q9UKI8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLK1Q9UKI8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLK1Q9UKI8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLK1Q9UKI8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLK1Q9UKI8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLK1Q9UKI8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLK1Q9UKI8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TLK1Q9UKI8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLK1Q9UKI8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLK1Q9UKI8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLK1Q9UKI8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLK1Q9UKI8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TLK1Q9UKI8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TLK1Q9UKI8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TLK1Q9UKI8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TLK1Q9UKI8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLK1Q9UKI8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TLK1Q9UKI8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLK1Q9UKI8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLK1Q9UKI8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLK1Q9UKI8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLK1Q9UKI8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLK1Q9UKI8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLK1Q9UKI8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLK1Q9UKI8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLK1Q9UKI8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLK1Q9UKI8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms