Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF2Q9UK05 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF2Q9UK05 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF2Q9UK05 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF2Q9UK05 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF2Q9UK05 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF2Q9UK05 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF2Q9UK05 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF2Q9UK05 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF2Q9UK05 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF2Q9UK05 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF2Q9UK05 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF2Q9UK05 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF2Q9UK05 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF2Q9UK05 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF2Q9UK05 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF2Q9UK05 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF2Q9UK05 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF2Q9UK05 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms