Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNAI1Q9UI46 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNAI1Q9UI46 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNAI1Q9UI46 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNAI1Q9UI46 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNAI1Q9UI46 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DNAI1Q9UI46 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAI1Q9UI46 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAI1Q9UI46 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAI1Q9UI46 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAI1Q9UI46 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAI1Q9UI46 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAI1Q9UI46 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNAI1Q9UI46 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DNAI1Q9UI46 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNAI1Q9UI46 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNAI1Q9UI46 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAI1Q9UI46 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAI1Q9UI46 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAI1Q9UI46 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAI1Q9UI46 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAI1Q9UI46 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAI1Q9UI46 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAI1Q9UI46 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAI1Q9UI46 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAI1Q9UI46 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms