Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NPC1L1Q9UHC9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NPC1L1Q9UHC9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NPC1L1Q9UHC9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NPC1L1Q9UHC9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NPC1L1Q9UHC9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NPC1L1Q9UHC9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NPC1L1Q9UHC9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NPC1L1Q9UHC9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NPC1L1Q9UHC9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
NPC1L1Q9UHC9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NPC1L1Q9UHC9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NPC1L1Q9UHC9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NPC1L1Q9UHC9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NPC1L1Q9UHC9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NPC1L1Q9UHC9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NPC1L1Q9UHC9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NPC1L1Q9UHC9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NPC1L1Q9UHC9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NPC1L1Q9UHC9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NPC1L1Q9UHC9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NPC1L1Q9UHC9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NPC1L1Q9UHC9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NPC1L1Q9UHC9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NPC1L1Q9UHC9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NPC1L1Q9UHC9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NPC1L1Q9UHC9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NPC1L1Q9UHC9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NPC1L1Q9UHC9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NPC1L1Q9UHC9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NPC1L1Q9UHC9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NPC1L1Q9UHC9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NPC1L1Q9UHC9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NPC1L1Q9UHC9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NPC1L1Q9UHC9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NPC1L1Q9UHC9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NPC1L1Q9UHC9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NPC1L1Q9UHC9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NPC1L1Q9UHC9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NPC1L1Q9UHC9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NPC1L1Q9UHC9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NPC1L1Q9UHC9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NPC1L1Q9UHC9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NPC1L1Q9UHC9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NPC1L1Q9UHC9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NPC1L1Q9UHC9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NPC1L1Q9UHC9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NPC1L1Q9UHC9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NPC1L1Q9UHC9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NPC1L1Q9UHC9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NPC1L1Q9UHC9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NPC1L1Q9UHC9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NPC1L1Q9UHC9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NPC1L1Q9UHC9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
NPC1L1Q9UHC9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms