Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRD1Q9P1U0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRD1Q9P1U0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms