Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TMOD3Q9NYL9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TMOD3Q9NYL9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TMOD3Q9NYL9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TMOD3Q9NYL9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TMOD3Q9NYL9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TMOD3Q9NYL9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TMOD3Q9NYL9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TMOD3Q9NYL9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TMOD3Q9NYL9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TMOD3Q9NYL9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TMOD3Q9NYL9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TMOD3Q9NYL9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TMOD3Q9NYL9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TMOD3Q9NYL9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TMOD3Q9NYL9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TMOD3Q9NYL9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TMOD3Q9NYL9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TMOD3Q9NYL9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TMOD3Q9NYL9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TMOD3Q9NYL9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TMOD3Q9NYL9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TMOD3Q9NYL9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TMOD3Q9NYL9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TMOD3Q9NYL9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TMOD3Q9NYL9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TMOD3Q9NYL9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TMOD3Q9NYL9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TMOD3Q9NYL9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TMOD3Q9NYL9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TMOD3Q9NYL9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TMOD3Q9NYL9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TMOD3Q9NYL9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TMOD3Q9NYL9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TMOD3Q9NYL9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TMOD3Q9NYL9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TMOD3Q9NYL9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TMOD3Q9NYL9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TMOD3Q9NYL9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TMOD3Q9NYL9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TMOD3Q9NYL9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TMOD3Q9NYL9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TMOD3Q9NYL9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TMOD3Q9NYL9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TMOD3Q9NYL9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TMOD3Q9NYL9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TMOD3Q9NYL9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TMOD3Q9NYL9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TMOD3Q9NYL9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TMOD3Q9NYL9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TMOD3Q9NYL9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TMOD3Q9NYL9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TMOD3Q9NYL9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TMOD3Q9NYL9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TMOD3Q9NYL9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TMOD3Q9NYL9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TMOD3Q9NYL9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms