Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBA8Q9NY65 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA8Q9NY65 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBA8Q9NY65 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBA8Q9NY65 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBA8Q9NY65 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms