Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCM2LQ9NUG4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCM2LQ9NUG4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCM2LQ9NUG4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCM2LQ9NUG4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCM2LQ9NUG4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCM2LQ9NUG4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCM2LQ9NUG4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCM2LQ9NUG4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCM2LQ9NUG4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCM2LQ9NUG4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCM2LQ9NUG4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCM2LQ9NUG4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCM2LQ9NUG4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCM2LQ9NUG4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCM2LQ9NUG4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCM2LQ9NUG4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCM2LQ9NUG4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCM2LQ9NUG4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCM2LQ9NUG4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCM2LQ9NUG4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCM2LQ9NUG4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms