Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA2

SLC17A5, Sialin, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A5Q9NRA2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A5Q9NRA2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A5Q9NRA2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A5Q9NRA2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A5Q9NRA2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A5Q9NRA2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A5Q9NRA2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A5Q9NRA2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A5Q9NRA2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A5Q9NRA2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A5Q9NRA2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A5Q9NRA2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A5Q9NRA2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A5Q9NRA2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A5Q9NRA2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A5Q9NRA2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC17A5Q9NRA2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC17A5Q9NRA2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC17A5Q9NRA2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC17A5Q9NRA2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC17A5Q9NRA2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC17A5Q9NRA2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms